有限合伙企業(yè)的所得稅計算涉及合伙企業(yè)本身和合伙人兩個層面，具體如下：
一、合伙企業(yè)層面
根據(jù)《關(guān)于合伙企業(yè)合伙人所得稅問題的通知》（財稅[2008]159號），有限合伙企業(yè) 本身不繳納企業(yè)所得稅，而是實行“先分后稅”原則，即利潤穿透至合伙人，由合伙人分別繳納所得稅。 
二、合伙人層面
合伙人的所得稅根據(jù)其身份（自然人、法人或其他組織）和所得性質(zhì)（經(jīng)營所得、股息紅利等）分別計算：
1. 自然人合伙人
經(jīng)營所得：
適用5%-35%超額累進稅率（個體工商戶稅率），按年計算。
計算公式：
應納稅額 = 應納稅所得額 × 稅率 - 速算扣除數(shù)
（應納稅所得額 = 合伙企業(yè)利潤 × 分配比例 + 其他經(jīng)營所得）
注：若合伙企業(yè)從事股權(quán)投資，部分地區(qū)（如上海）按35%稅率征收。
股息、紅利所得：
適用20%比例稅率（按“利息、股息、紅利所得”項目）。
股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得：
部分地區(qū)按“財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得”20%稅率，部分地區(qū)按5%-35%累進稅率（需咨詢當?shù)囟悇照撸?/p>
2. 法人合伙人（公司或其他組織）
- 取得的利潤并入其應納稅所得額，按 25%企業(yè)所得稅稅率（或優(yōu)惠稅率）計算。
- 若合伙企業(yè)投資上市公司分紅，法人合伙人可享受免稅政策（《企業(yè)所得稅法》第26條）。
3. 其他合伙企業(yè)（如GP為合伙企業(yè)）
利潤繼續(xù)穿透至最終自然人/法人合伙人，按上述規(guī)則計稅。
三、其他注意事項
稅務申報：
- 合伙企業(yè)需填報《個人所得稅生產(chǎn)經(jīng)營所得納稅申報表》（自然人合伙人）或《企業(yè)所得稅申報表》（法人合伙人）。
- 自然人合伙人通常由合伙企業(yè)代扣代繳或自行申報。
地方差異：
部分地區(qū)對股權(quán)投資類合伙企業(yè)的自然人合伙人執(zhí)行20%稅率（如西藏、新疆），需以當?shù)卣邽闇省?/p>
虧損處理：
合伙企業(yè)的虧損不得抵扣合伙人其他收入，僅可結(jié)轉(zhuǎn)以后年度抵減同類所得。
示例計算
假設某有限合伙企業(yè)年度利潤500萬元，分配比例如下：
- 自然人合伙人A（經(jīng)營所得）：60%
- 法人合伙人B：40%
自然人合伙人A：
應納稅所得額 = 500萬 × 60% = 300萬
按35%稅率計算：300萬 × 35% - 6.55萬（速算扣除數(shù)） ≈ 98.45萬元
法人合伙人B：
應納稅所得額 = 500萬 × 40% = 200萬
按25%稅率計算：200萬 × 25% = 50萬元
建議結(jié)合具體業(yè)務類型和地區(qū)政策進行稅務籌劃，必要時咨詢玖邀開業(yè)專業(yè)機構(gòu)。
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